１細胞の遺伝子発現データを用いた細胞分化の軌跡推定
早水桃子 (早稲田大学講師)
AI・データ利活用研究会 第25回
１細胞の遺伝子発現データを用いた細胞分化の軌跡推定
早水桃子 (早稲田大学講師)
細胞の分化とは，細胞が成熟して見た目や機能が変化するプロセスのことである．動物細胞の場合，細胞の分化は基本的に不可逆的な変化であるため，幹細胞が分化しうる軌跡の全体像は一つのツリーで表現できるはずだという信念が細胞生物学には古くからある．データから細胞分化の軌跡（ツリー構造）を解明する課題は細胞生物学における究極の目標の一つであるとともに，幹細胞医学・工学への応用上の観点でも重要である．約10年前に起きた実験計測上のブレークスルーにより，今日では１個１個の細胞の中で各遺伝子の発現量を網羅的に定量した「１細胞」レベルの遺伝子発現データが盛んに取得されるようになったが，このタイプのデータの利活用に関してはまだ多くの数理的な課題がある．本講演では，１細胞の遺伝子発現データを用いた細胞分化の軌跡推定の意義と難しさ，課題を解決するための数理的アイデア，開発したソフトウェアなどについて紹介する．
| 講師： | 早水桃子 (早稲田大学講師) |
|---|---|
| テーマ： | AI・データ利活用研究会 第25回 |
| 日時： | 2021年12月10日(金) 講演 18:10-19:10 質疑 19:10-20:10 |
| 場所： | オンライン開催 |
| 参加費： | 無料 |
| 参加方法： | Zoomウェビナーを用いたオンラインでの開催となります。 参加ご希望者は以下の ・Googleフォーム https://forms.gle/12ttActwKbp4zoVH7 にご記入いただくか ・自動配信システムへの登録 http://www-mmds.sigmath.es.osaka-u.ac.jp/structure/activity/ai_data_index.php をご検討ください。 自動配信システムへご登録いただいた方にはID・パスワードが発行され、今後の 同研究会開催情報及び数理・データ科学教育研究センター関連団体の情報を自動 配信いたします（詳細は上記のページをご確認下さい）。 |
| アクセス： | オンライン開催 |
| お問い合せ： | 本ウェブサイトの「お問い合せ」のページをご参照ください。 |